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中华肝脏外科手术学电子杂志

中华肝脏外科手术学电子杂志 ›› 2024, Vol. 13 ›› Issue (02) : 205 -213. doi: 10.3877/cma.j.issn.2095-3232.2024.02.015

基础研究

DEP结构域蛋白1B在肝细胞癌中的表达及功能
夏辉1, 戴斌1,†(), 冉君2, 王威1, 龚昭1, 周程1   
  1. 1. 430000　武汉市第一医院肝胆外科
    2. 430000　武汉，华中科技大学同济医学院附属同济医院放射科
  • 收稿日期:2024-01-03 出版日期:2024-04-10
  • 通信作者: 戴斌
  • 基金资助:
    湖北省自然科学基金(2022CFB980); 武汉市卫生健康委员会医学科研项目(WZ21Q11)

Expression and function of DEP domain-containing protein 1B in hepatocellular carcinoma

Hui Xia1, Bin Dai1,†(), Jun Ran2, Wei Wang1, Zhao Gong1, Cheng Zhou1   

  1. 1. Department of Hepatobiliary Surgery, First Hospital of Wuhan, Wuhan 430000, China
    2. Department of Radiology, Tongji Hospital, Tongji Medical College of Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430000, China
  • Received:2024-01-03 Published:2024-04-10
  • Corresponding author: Bin Dai
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引用本文：

夏辉, 戴斌, 冉君, 王威, 龚昭, 周程. DEP结构域蛋白1B在肝细胞癌中的表达及功能[J]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2024, 13(02): 205-213.

Hui Xia, Bin Dai, Jun Ran, Wei Wang, Zhao Gong, Cheng Zhou. Expression and function of DEP domain-containing protein 1B in hepatocellular carcinoma[J]. Chinese Journal of Hepatic Surgery(Electronic Edition), 2024, 13(02): 205-213.

目的

探讨DEP结构域蛋白1B（DEPDC1B）在肝细胞癌（肝癌）中的表达及功能。

方法

检索公共癌症数据库（UALCAN、HPA）分析DEPDC1B在肝癌中的表达；从癌症基因组图谱（TCGA）数据库（https://portal.gdc.com）获得肝癌的RNAseq数据（level3）和相应的临床信息，Log-rank用于检验Kaplan-Meier生存分析比较上述两组或多组之间的生存差异；单因素及多因素Cox分析DEPDC1B的预后价值并构建列线图。利用siRNA抑制DEPDC1B表达，通过Transwell小室实验检测细胞侵袭、迁移变化；利用STRING构建DEPDC1B蛋白质相互作用网络（PPI）并分析其在肝癌中潜在作用机制。

结果

肝癌组织中DEPDC1B基因表达量明显高于正常组织（P<0.05）。肝癌DEPDC1B蛋白的阳性表达率为70%，在20种常见癌症的阳性表达率中排名第一。TCGA数据分析显示，DEPDC1B高表达肝癌患者总体生存期和无病生存期均较差（HR=1.673，1.434；P<0.05），其可作为肝癌的独立预后因子且能效预测患者生存率。Transwell小室实验结果显示，siRNA能明显抑制MHCC97-H、Hep3B肝癌细胞DEPDC1Bb表达；下调DEPDC1B表达后，肿瘤细胞的侵袭及迁移能力减弱。PPI网络构建分析显示，DEPDC1B与TsC/mTOR、RTK、RAS/MAPK、PI3K/AKT、雌激素受体、雄激素受体、上皮间质转化、DNA损伤反应、细胞周期和细胞凋亡等肿瘤标志性信号通路密切相关。

结论

DEPDC1B在肝癌中高表达，其高表达与患者预后差相关，下调其表达肝癌细胞侵袭迁移能力下降。

关键词: 癌，肝细胞, DEP结构域蛋白1B, 预后, 侵袭, 迁移
Objective

To investigate the expression and function of DEP domain-containing protein 1B (DEPDC1B) in hepatocellular carcinoma (HCC).

Methods

Public cancer databases (UALCAN, HPA) were searched to analyze the expression profile of DEPDC1B in HCC. RNAseq data (level 3) and corresponding clinical information of HCC were obtained from The Cancer Genome Atlas (TCGA) (https://portal.gdc.com). Kaplan-Meier survival analysis was performed using Log-rank test to compare the survival differences between two groups or among multiple groups. Prognostic value of DEPDC1B was assessed by using univariate and multivariate Cox analysis and the nomogram was established. The expression of DEPDC1B was inhibited by siRNA. The changes of cell invasion and migration were detected by Transwell chamber assay. Protein-protein interaction (PPI) of DEPDC1B was constructed by using STRING and the underlying mechanism in HCC was unraveled.

Results

The expression level of DEPDC1B gene in HCC tissues was significantly higher than that in normal tissues (P<0.05). The positive expression rate of DEPDC1B protein in HCC was 70%, ranking the first among 20 common cancers. TCGA data analysis showed that the overall survival and disease-free survival of HCC patients with high DEPDC1B expression were poor (HR=1.673, 1.434; P<0.05), which could be utilized as an independent prognostic factor of HCC and effectively predict the survival rate of HCC patients. Transwell chamber assay revealed that siRNA could significantly inhibit the expression levels of DEPDC1Bb in MHCC97-H and Hep3B cells. After down-regulating the expression of DEPDC1B, the invasion and migration capabilities of tumor cells were weakened. PPI network showed that DEPDC1B was intimately associated with tumor signaling pathways, such as TsC/mTOR, RTK, RAS/MAPK, PI3K/AKT, estrogen receptor, androgen receptor, epithelial-mesenchymal transition, DNA damage response, cell cycle and apoptosis, etc.

Conclusions

DEPDC1B is highly expressed in HCC. High expression of DEPDC1B is correlated with poor prognosis of HCC patients. Down-regulating the expression of DEPDC1B can weaken the invasion and migration capabilities of HCC cells.

Key words: Carcinoma, hepatocellular, DEP domain-containing 1B (DEPDC1B), Prognosis, Invasion, Migration
图1 DEPDC1B在正常人体组织样本中基因表达谱注：数据均来自于人类蛋白质图谱（HPA），DEPDC1B为DEP结构域蛋白1B
图2 DEPDC1B在正常人体组织样本中蛋白表达谱注：数据均来自于人类蛋白质图谱（HPA），DEPDC1B为DEP结构域蛋白1B
图3 DEPDC1B mRNA在肝癌组织和正常肝组织中的表达注：数据均来自于UALCAN数据库，DEPDC1B为DEP结构域蛋白1B，※为P<0.05；Transcript per million为每百万条reads的转录本
图4 DEPDC1B蛋白在肝癌组织的表达（免疫组织化法）注：DEPDC1B为DEP结构域蛋白1B
图5 DEPDC1B在肝癌中的预后价值注：a为DEPDC1B在肝癌中的预后价值Kaplan-Meier生存曲线；b为单因素和多因素Cox分析；c为列线图可预测肝癌患者1、3、5年总体生存期；DEPDC1B为DEP结构域蛋白1B
表1 Kaplan-Meier Plotter中肝癌组织DEPDC1B mRNA表达与临床预后的关系
项目 OS DFS
例数 HR P 例数 HR P
性别            
女性 118 1.96（1.11～3.46） 0.019 105 2.82（1.54～5.16） <0.001
男性 246 2.20（1.40～3.44） <0.001 208 1.69（1.08～2.65） 0.020
TNM分期            
1 170 1.78（0.97～3.27） 0.060 153 1.63（0.94～2.81） 0.078
2 83 3.08（1.15～8.23） 0.018 74 1.90（0.79～4.58） 0.140
3 83 2.23（1.23～4.05） 0.001 68 2.69（1.23～5.87） 0.010
4 4     0    
AJCC-T分期            
1 181 1.78（1.00～3.17） 0.048 160 1.67（0.98～2.85） 0.056
2 90 3.15（1.20～8.28） 0.014 79 1.80（0.80～4.08） 0.150
3 78 2.18（1.19～4.01） 0.005 65 2.51（1.17～5.37） 0.015
4 13     6    
组织学分级            
1 55 5.02（1.66～15.13） 0.002 45 3.08（0.70～13.66） 0.120
2 174 2.53（1.31～4.88） 0.004 147 2.13（1.21～3.74） 0.008
3 118 1.98（1.09～3.61） 0.022 106 1.78（1.02～3.10） 0.040
4 12     11    
血管侵犯            
无 203 1.87（1.12～3.14） 0.016 175 1.44（0.88～2.36） 0.150
微血管 90 1.88（0.79～4.46） 0.150 81 2.63（1.16～5.97） 0.016
大血管 16     14    
索拉非尼 29 6.21（0.77～49.84） 0.054 22 2.48（0.87～7.08） 0.082
饮酒            
有 115 1.84（0.97～3.50） 0.059 98 2.60（1.41～4.79） 0.002
无 202 2.00（1.26～3.18） 0.003 182 1.63（1.05～2.55） 0.029
肝炎病毒            
有 150 1.39（0.07～2.67） 0.310 138 1.27（0.74～2.15） 0.390
无 167 3.68（1.97～6.87） <0.001 142 3.92（2.01～7.62） <0.001
图6 DEPDC1B对肝癌细胞侵袭迁移能力的影响注：a为siRNA能明显抑制MHCC97-H、Hep3B中DEPDC1B表达水平；b为细胞迁移和侵袭实验，相比于对照组，siRNA处理组中肝癌细胞侵袭迁移能力下降，※为P<0.05；DEPDC1B为DEP结构域蛋白1B
图7 DEPDC1B的PPI网络构建注：DEPDC1B为DEP结构域蛋白1B，PPI为蛋白质-蛋白质相互作用，RHO为RAS同源家族成员，RAC为Ras相关的C3肉毒素底物，CDC42为细胞分裂周期42蛋白
[1]
Sung H, Ferlay J, Siegel RL, et al. Global cancer statistics 2020: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for36 cancers in 185 countries[J]. CA Cancer J Clin, 2021, 71(3):209-249.
[2]
Shi Y, Men X, Li X, et al. Research progress and clinical prospect of immunocytotherapy for the treatment of hepatocellular carcinoma[J]. Int Immunopharmacol, 2020(82):106351.
[3]
Chen X, Guo ZQ, Cao D, et al. Knockdown of DEPDC1B inhibits the development of glioblastoma[J]. Cancer Cell Int, 2020(20):310.
[4]
Zhang S, Shi W, Hu W, et al. DEP domain-containing protein 1B (DEPDC1B) promotes migration and invasion in pancreatic cancer through the Rac1/PAK1-LIMK1-Cofilin1 signaling pathway[J]. Onco Targets Ther, 2020(13):1481-1496.
[5]
Mosaddeghzadeh N, Ahmadian MR. The RHO family GTPases: mechanisms of regulation and signaling[J]. Cells, 2021, 10(7):1831.
[6]
Lawson CD, Ridley AJ. Rho GTPase signaling complexes in cell migration and invasion[J]. J Cell Biol, 2018, 217(2):447-457.
[7]
Bai S, Chen T, Du T, et al. High levels of DEPDC1B predict shorter biochemical recurrence-free survival of patients with prostate cancer[J]. Oncol Lett, 2017, 14(6):6801-6808.
[8]
Xu Y, Sun W, Zheng B, et al. DEPDC1B knockdown inhibits the development of malignant melanoma through suppressing cell proliferation and inducing cell apoptosis[J]. Exp Cell Res, 2019, 379(1):48-54.
[9]
Ganesan P, Kulik LM. Hepatocellular carcinoma: new developments[J]. Clin Liver Dis, 2023, 27(1):85-102.
[10]
Forner A, Reig M, Bruix J. Hepatocellular carcinoma[J]. Lancet, 2018, 391(10127):1301-1314.
[11]
Lai CH, Xu K, Zhou J, et al. DEPDC1B is a tumor promotor in development of bladder cancer through targeting SHC1[J]. Cell Death Dis, 2020, 11(11):986.
[12]
Sun Y, Zhang Z. In silico identification of crucial genes and specific pathways in hepatocellular cancer[J]. Genet Test Mol Biomarkers, 2020, 24(5):296-308.
[13]
Wang L, Tang L, Xu R, et al. DEPDC1B regulates the progression of human chordoma through UBE2T-mediated ubiquitination of BIRC5[J]. Cell Death Dis, 2021, 12(8):753.
[14]
Su YF, Liang CY, Huang CY, et al. A putative novel protein, DEPDC1B, is overexpressed in oral cancer patients, and enhanced anchorage-independent growth in oral cancer cells that is mediated by Rac1 and ERK[J]. J Biomed Sci, 2014, 21(1):67.
[15]
Kikuchi R, Sampetrean O, Saya H, et al. Functional analysis of the DEPDC1 oncoantigen in malignant glioma and brain tumor initiating cells[J]. J Neurooncol, 2017, 133(2):297-307.
[16]
Dang XW, Pan Q, Lin ZH, et al. Overexpressed DEPDC1B contributes to the progression of hepatocellular carcinoma by CDK1[J]. Aging, 2021, 13(16):20094-20115.
[17]
Shen E, Zhang J, Lu Y. DEP domain containing 1B (DEPDC1B) exerts the tumor promoter in hepatocellular carcinoma through activating p53 signaling pathway via kinesin family member 23 (KIF23)[J]. Bioengineered, 2022, 13(1):1103-1114.
[18]
Pawlik TM, Delman KA, Vauthey JN, et al. Tumor size predicts vascular invasion and histologic grade: implications for selection of surgical treatment for hepatocellular carcinoma[J]. Liver Transplant, 2005, 11(9):1086-1092.
[19]
Xu S, Zhan M, Wang J. Epithelial-to-mesenchymal transition in gallbladder cancer: from clinical evidence to cellular regulatory networks[J]. Cell Death Discov, 2017(3):17069.
[20]
Sengez B, Carr BI, Alotaibi H. EMT and inflammation: crossroads in HCC[J]. J Gastrointest Cancer, 2023, 54(1):204-212.
[21]
Liu X, Li T, Huang X, et al. DEPDC1B promotes migration and invasion in pancreatic ductal adenocarcinoma by activating the Akt/GSK3β/Snail pathway[J]. Oncol Lett, 2020, 20(5):146.
[1] 王晓梅, 刘冰, 马丽琼, 卢祖静, 苗建军. 基于LASSO-Cox回归分析的非轻症急性胰腺炎死亡风险列线图预测模型的建立和临床应用效果分析[J]. 中华普通外科学文献(电子版), 2024, 18(01): 44-50.
[2] 刘政宏, 王凤力, 吉亚君, 高佳. 胃癌中ELK3蛋白的表达与临床病理特征和预后的关系研究[J]. 中华普外科手术学杂志(电子版), 2024, 18(02): 155-159.
[3] 张琳, 李婷. CRIP1在胃癌中的表达及与临床病理指标和预后的关系研究[J]. 中华普外科手术学杂志(电子版), 2024, 18(02): 171-175.
[4] 栗艳松, 冯会敏, 刘明超, 刘泽鹏, 姜秋霞. STIP1在三阴性乳腺癌组织中的表达及临床意义研究[J]. 中华普外科手术学杂志(电子版), 2024, 18(01): 52-56.
[5] 马伟强, 马斌林, 吴中语, 张莹. microRNA在三阴性乳腺癌进展中发挥的作用[J]. 中华普外科手术学杂志(电子版), 2024, 18(01): 111-114.
[6] 张生军, 赵阿静, 李守博, 郝祥宏, 刘敏丽. 高糖通过HGF/c-met通路促进结直肠癌侵袭和迁移的实验研究[J]. 中华普外科手术学杂志(电子版), 2024, 18(01): 21-24.
[7] 杨倩, 李翠芳, 张婉秋. 原发性肝癌自发性破裂出血急诊TACE术后的近远期预后及影响因素分析[J]. 中华普外科手术学杂志(电子版), 2024, 18(01): 33-36.
[8] 朱显钟, 李金雨, 于忠英, 温路生. 淋巴结平均直径与无淋巴结转移肾癌病理特征及预后关系研究[J]. 中华腔镜泌尿外科杂志(电子版), 2024, 18(02): 146-151.
[9] 宋玮, 黄修丽, 李鑫, 史雅琼, 张晔, 邓飞, 高燕. 改良衰弱指数对重症肺部感染的预后分析[J]. 中华肺部疾病杂志(电子版), 2024, 17(01): 119-122.
[10] 王礼光, 严庆, 廖珊, 符荣党, 陈焕伟. 微血管侵犯及手术切缘对肝细胞癌患者术后生存预后的影响[J]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2024, 13(02): 151-157.
[11] 杨建彬, 陈建华, 张文华, 刘建东. 中心静脉压差值对腹腔镜肝细胞癌肝切除术中出血的影响[J]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2024, 13(02): 158-162.
[12] 马振威, 朱博, 刘赋斌, 邓正栋, 王剑明. 血小板和淋巴细胞比值联合CA19-9在胆囊癌术后患者预后评估中的价值[J]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2024, 13(02): 163-168.
[13] 朱迎, 赵征, 许达, 陆录, 殷保兵. 免疫检查点抑制剂治疗肝细胞癌的进展与展望[J]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2024, 13(01): 5-10.
[14] 张占国. 靶向免疫治疗时代的肝癌肝切除术再思考[J]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2024, 13(01): 11-15.
[15] 孙振, 谭天华, 郑洋洋, 李喆, 宋京海. 基于术前纤维蛋白原与白蛋白比值构建肝癌微血管侵犯的预测模型[J]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2024, 13(01): 27-32.
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